Backofen auf 200°C (Ober- und Unterhitze) vorheizen. Zwiebel schälen und in Würfel schneiden. Tomaten waschen und ebenfalls klein schneiden. Olivenöl in einer großen (ofengeeigneten) Pfanne erhitzen und die Zwiebel darin glasig dünsten. Tomaten zufügen und kurz anbraten.
Mit passierten Tomaten und Sahne ablöschen. Creme fraîche und Gewürze zufügen, aufkochen lassen und ggf. noch mit etwas Salz und Pfeffer abschmecken.
Die Maultaschen in die Soße legen, mit Käse bestreuen und etwa 15 - 20 Minuten im Backofen überbacken lassen. Wer eine ofengeeignete Pfanne besitzt, kann diese einfach direkt in den Backofen geben. Ansonsten kann man die Maultaschen natürlich auch in eine Auflaufform legen und mit der Soße übergießen.